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Synonyms:
   Firmicutes 

Broader Terms:
   Bacteria 
   Bacteria regnum 
   Eubacteria 
   Firmicutes 

More Specific:
   Bacilli 
   Clostridia 
   Firmicutes str ikaite 
   Gram positive walls 
   Mollicutes 
   environmental samples 
   unclassified 
 
 
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Common Names: low GC Gram+, low G+C Gram-positive bacteria, Gram-positive bacteria



1.  Characterization of Tonsil Microbiota and Their Effect on Adenovirus Reactivation in Tonsillectomy Samples.LinkIT
Wang L, Xu D, Huang Q, Yang G, Zhang M, Bi J, Shan J, Li E, He S
Microbiology spectrum, 2021
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0

2.  Comparative Analysis of the Cultured and Total Bacterial Community in the Wheat Rhizosphere Microbiome Using Culture-Dependent and Culture-Independent Approaches.LinkIT
Youseif SH, Abd El-Megeed FH, Humm EA, Maymon M, Mohamed AH, Saleh SA, Hirsch AM
Microbiology spectrum, 2021
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0

3.  Biotransformation of Ginsenosides (Rb1, Rb2, Rb3, Rc) in Human Intestinal Bacteria and Its Effect on Intestinal Flora.LinkIT
Zheng F, Zhang MY, Wu YX, Wang YZ, Li FT, Han MX, Dai YL, Yue H
Chemistry & biodiversity, 2021
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0

4.  Sandalwood seed oil improves insulin sensitivity in high-fat/high-sucrose diet-fed rats associated with altered intestinal microbiota and its metabolites.LinkIT
Gao X, Zhang H, Li K, Shi Y, Guo X, Wang L, Li D
Food & function, 2021
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0

5.  Astaxanthin from Haematococcus pluvialis alleviates obesity by modulating lipid metabolism and gut microbiota in mice fed a high-fat diet.LinkIT
Wang M, Ma H, Guan S, Luo T, Zhao C, Cai G, Zheng Y, Jia X, Di J, Li R, Cui H
Food & function, 2021
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0

6.  Effect of topical medication on the nasomaxillary skin-fold microbiome in French bulldogs.LinkIT
Rexo A, Hansen B, Clarsund M, Krumbeck JA, Bernstein J
Veterinary dermatologyVet DermatolEffect of topical medication on the nasomaxillary skin-fold microbiome in French bulldogs.10.1111/vde.13017Host-microbe interactions may influence dermatitis pathogenesis in the nasomaxillary folds of French bulldogs, which is often complicated by secondary bacterial and fungal infections.To assess the skin-fold microbiome in systemically healthy French bulldogs and to determine the influence of topical medications on this microbiome.Nineteen healthy French bulldogs.Next-generation DNA sequencing was applied to characterise the microbiome composition in the nasomaxillary folds of systemically healthy French bulldogs. Subsequently, the effect of two topical products on the fold microbiome was assessed. Seven dogs were treated with a protease product (Kalzyme; enzyme) that inhibits biofilm formation without biocidal activity, six dogs were treated with a 2% chlorhexidine diacetate solution (Nolvasan; CHX) with biocidal activity, and six dogs were untreated. Dogs were randomly assigned to each group, and the investigator was blinded.The primary skin bacterial phyla inhabiting the folds at inclusion were Firmicutes, Actinobacteria and Proteobacteria. The primary skin fungal phyla were Ascomycota and Basidiomycota. Topical treatment increased the diversity of bacterial and fungal compositions over time (increase in microbial diversity score: enzyme 38%, chlorhexidine 11%, control <5%) and the relative abundance of pathogens reduced significantly (enzyme, P = 0.028; CHX, P = 0.048). A clear correlation (r2  = 0.83) was observed between the abundance of clinically relevant pathogens and microbial diversity.The nasomaxillary skin-fold microbiome of healthy French bulldogs contained a high abundance of clinically relevant pathogens (mean 36.4%). Topical therapy with enzyme increased microbial diversity of skin folds and reduced the relative abundance of pathogens.© 2021 ESVD and ACVD.RexoAlissaAhttps://orcid.org/0000-0002-6409-7441Dermatology and Allergy Services for Animals, Springfield, VA, 22150, USA.HansenBruceBDermatology and Allergy Services for Animals, Springfield, VA, 22150, USA.ClarsundMatsMDivision of Biotechnology, Lund University, Lund, 223 63, Sweden.KrumbeckJanina AJAZymo Research Corporation, 17062 Murphy Ave, Irvine, CA, 92614, USA.BernsteinJosephJLong Green Animal Dermatology Baldwin, MD, 21013, USA.engJournal Article20211019EnglandVet Dermatol94261870959-4493IMLes interactions hôte-microbe peuvent influencer la pathogénie de la dermatite dans les plis naso-maxillaires du bouledogue français, souvent compliquée par des infections bactériennes et fongiques secondaires.Evaluer le microbiome des plis cutanés chez les bouledogues français sains et déterminer l?influence des médications topiques sur ce microbiome.Dix neuf bouledogues français sains. MATÉRIELS ET MÉTHODES: Le séquençage d?ADN de dernière génération a été appliqué pour caractériser la composition du microbiome des plis naso-maxillaires de bouledogues français sains. L?effet de deux topiques sur le microbiome des plis a été évalué. Sept chiens ont été traités avec protéase (Kalzyme; enzyme) qui inhibe la formation de biofilm sans activité biocide, six chiens étaient non traités. Les chiens ont été répartis au hasard dans chaque groupe et l?investigateur était en aveugle. RÉSULTATS: Les phyla bactériens cutanés primaires inhibant les plis à l?inclusion étaient Firmicutes, Actinobacteria et Proteobacteria. Les phyla fongiques primaires cutanés étaient Ascomycota et Basidiomycota. Le traitement topique a augmenté la diversité des compositions bactériennes et fongiques dans le temps (augmentation du score de diversité microbienne : enzyme 38%, chlorhexidine 11%, contrôle <5%) et l?abondance relative des pathogènes a diminué significativement (enzyme, P = 0.028; CHX, P = 0.048). Une corrélation nette (r = 0.83) a été observée entre l?abondance des pathogènes cliniquement importants et la diversité microbienne.Le microbiome des plis cutanés naso-maxillaires des bouledogues français sains contient une abondance élevée de pathogènes cliniquement significatifs (moyenne 36,4%). Le traitement topique avec enzyme augmente la diversité microbienne des plis cutanés et réduit l?abondance relative des pathogènes.INTRODUCCIÓN: las interacciones huésped-microbio pueden influir en la patogenia de la dermatitis en los pliegues nasomaxilares de los Bulldogs Franceses, que a menudo se complica por infecciones bacterianas y fúngicas secundarias. OBJETIVO: evaluar el microbioma del pliegue cutáneo en Bulldogs Franceses sistémicamente sanos y determinar la influencia de los medicamentos tópicos en este microbioma. ANIMALES: diecinueve Bulldogs Franceses sistémicamente sanos. MÉTODOS Y MATERIALES: se aplicó la secuenciación de DNA de próxima generación para caracterizar la composición del microbioma en los pliegues nasomaxilares de Bulldogs Franceses sistémicamente sanos. Posteriormente, se evaluó el efecto de dos productos tópicos en el pliegue del microbioma. Siete perros fueron tratados con un producto de proteasa (Kalzyme; enzima) que inhibe la formación de biopelículas sin actividad biocida, seis perros fueron tratados con una solución de diacetato de clorhexidina al 2% (Nolvasan; CHX) con actividad biocida y seis perros no fueron tratados. Los perros se asignaron al azar a cada grupo y el investigador fue cegado. RESULTADOS: los filos de bacterias cutáneas primarias que habitaban los pliegues en el momento de la inclusión fueron Firmicutes, Actinobacteria y Proteobacteria. Los principales filos fúngicos de la piel fueron Ascomycota y Basidiomycota. El tratamiento tópico aumentó la diversidad de composiciones bacterianas y fúngicas con el tiempo (aumento en la puntuación de diversidad microbiana: enzima 38%, clorhexidina 11%, control <5%) y la abundancia relativa de patógenos se redujo significativamente (enzima, P = 0,028; CHX, P = 0,048). Se observó una clara correlación (r 2 = 0,83) entre la abundancia de patógenos clínicamente relevantes y la diversidad microbiana. CONCLUSIONES: el microbioma del pliegue cutáneo nasomaxilar de los Bulldogs Franceses sistémicamente sanos contiene una gran abundancia de patógenos clínicamente relevantes (media del 36,4%). La terapia tópica con enzimas aumenta la diversidad microbiana de los pliegues de la piel y reduce la abundancia relativa de patógenos.Die Interaktion von Wirt und Mikroben könnte die Pathogenese der Dermatitis in den nasomaxillären Falten von Französischen Bulldoggen, welche oft durch sekundäre bakterielle Infektionen oder durch Pilzinfektionen verkompliziert wird, beeinflussen. ZIEL: Eine Erfassung des Mikrobioms der Hautfalten bei systemisch gesunden Französischen Bulldoggen und eine Feststellung, welchen Einfluss eine topische Behandlung auf dieses Mikrobiom hat.Neunzehn systemisch gesunde Französische Bulldoggen.Next-Generation DNA-Sequenzierung wurde angewendet, um die Zusammensetzung des Mikrobioms in den nasomaxillären Falten von systemisch gesunden französischen Bulldoggen zu charakterisieren. In der Folge wurde die Auswirkung zweier topisch angewendeter Produkte auf das Mikrobiom der Falten erfasst. Sieben Hunde wurden mit einem Protease Produkt (Kalzyme; Enzym) behandelt, welches ohne eine biozide Wirkung Biofilmbildung verhindert, sechs Hunde wurden mit 2%iger Chlorhexidindiacetatlösung (Nolvasan; CHX) mit biozider Aktivität behandelt und sechs Hunde wurden nicht behandelt. Die Hunde wurden zufällig in die Gruppen eingeteilt, die UntersucherInnen wurden geblindet.Die bakteriellen Primärstämme, die die Falten bewohnten, waren Firmicutes, Actinobacteria und Proteobacteria. Die mykotischen Primärstämme waren Ascomycota und Basidiomycota. Durch die topische Behandlung vergrößerte sich mit der Zeit die Diversität der bakteriellen Zusammensetzung sowie der Zusammensetzung der Pilze (Zunahme des mikrobiellen Diversitätswerts: Enzym 38%, Chlorhexidin 11%, Kontrolle <5%) und die relative Häufigkeit der Pathogene war signifikant reduziert (Enzym, P = 0,028; CHX, P = 0,048). Eine deutliche Korrelation (r2 = 0,83) wurde zwischen der Häufigkeit der klinisch relevanten Pathogene und der mikrobiellen Diversität beobachtet.Die Mikrobiome der nasomaxillären Hautfalten von systemisch gesunden Französischen Bulldoggen beinhalten eine große Anzahl an klinisch relevanten Pathogenen (Durchschnitt 36,4%). Eine topische Therapie mit Enzymen erhöht die mikrobielle Diversität der Hautfalten und reduziert die relative Häufigkeit der Pathogene.??: ????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ??: ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ????: 19?????????????? ?????: ???DNA????????????????????????????????????????????????????????2???????????????????????????????7?????????????????????????????? (?????; ??) ??6???????????2%???????????????? (?????; CHX) ??6??????????????????????????????????????????? ??: ??????????????????????????Firmicutes?Actinobacteria?Proteobacteria????????????????Ascomycota???Basidiomycota???????????????????????????????????????? (????????????: ??38%?????????11%???5%??) ???????????????????? (???P = 0.028?CHX?P = 0.048) ?????????????????????????????????? (r2 = 0.83)????? ??: ?????????????????????????????????????????????? (??36.4%) ??????????????????????????????????????????????.??: ??-??????????????????????????, ??????????????? ??: ???????????????????, ????????????????? ??: 19???????????? ?????: ?????DNA??????????????????????, ????????, ????????????????????7??????????????????????? (Kalzyme; ?) ??, 6???????????2%????????(Nolvasan;CHX)??, 6?????????????????, ???????? ??: ??????????????????????????????????????????????????????, ?????????????????? (??????????: ?38%, ???11%, ?? < 5%) , ???????????? (?, P = 0.028;CHX,P = 0.048) ???????????????????????????????(r2 = 0.83)? ??: ???????????????????????????????? (??36.4%) ????????????????????, ????????????.As interações entre hospedeiro e microrganismo podem influenciar a patogênese da dermatite na dobra nasomaxilar de buldogues franceses, que é frequentemente complicada por infecções bacterianas e fúngicas secundárias.Avaliar o microbioma de dobras cutâneas em buldogues franceses sistêmicamente saudáveis e determinar a influência de medicações tópicas neste microbioma.Dezenove buldogues franceses sistêmicamente saudáveis. MÉTODOS E MATERIAIS: Sequenciamento de DNA de última geração foi aplicado para caracterizar a composição do microbioma nas dobras nasomaxilares de buldogues franceses sistêmicamente saudáveis. Subsequentemente, o efeito de dois produtos tópicos no microbioma da dobra foi avaliado. Sete cães foram tratados com um produto a base de protease (Kalzyme; enzima) que inibe a formação de biofilme sem atividade biocida, seis cães foram tratados com uma solução de diacetato de clorexidina a 2% (Nolvasan; CHX) com ação biocida, e seis cães não receberam tratamento. Os cães foram aleatoriamente divididos entre os grupos, e o investigador era cego.Os principais filos bacterianos habitantes das dobras cutâneas na inclusão no estudo foram Firmicutes, Actinobateria e Proteobacteria. Os principais filos de fungos foram Ascomycota e Basidiomycota. O tratamento tópico aumentou a diversidade das composições bacterianas e fúngicas ao longo do tempo (aumento no escore de diversidade microbiana: enzima 38%, clorexidine 11%, controle < 5%) e a abundância relativa de patógenos reduziu significativamente (enzima, P = 0,028; CHX, P = 0,048). Observou-se uma correlação clara (r = 0,83) entre a abundância de patógenos clinicamente relevantes e diversidade microbiana. CONCLUSÕES: O microbioma da dobra cutânea nasomaxilar de buldogues franceses sistêmicamente saudáveis contêm grande abundância de patógenos clinicamente relevantes (media 36,4%). Terapia tópica com enzima aumenta a diversidade microbianae reduz a abundância relative de patógenos.202103222021011820210512202110207520211021602021102160aheadofprint3466825610.1111/vde.13017References, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>7.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>Implementation of an automated cluster alert system into the routine work of infection control and hospital epidemiology: experiences from a tertiary care university hospital.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Aghdassi SJS, Kohlmorgen B, Schröder C, Peña Diaz LA, Thoma N, Rohde AM, Piening B, Gastmeier P, Behnke M<br><font color=gray><i>BMC infectious diseases, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>8.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>Effect of formaldehyde exposure on bacterial communities in simulating indoor environments.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Guo J, Xiong Y, Kang T, Zhu H, Yang Q, Qin C<br><font color=gray><i>Scientific reports, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>9.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>Characterization of polysaccharide from Pleurotus eryngii during simulated gastrointestinal digestion and fermentation.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Ma G, Xu Q, Du H, Muinde Kimatu B, Su A, Yang W, Hu Q, Xiao H<br><font color=gray><i>Food chemistry, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>10.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title><i>Aminipila luticellarii</i> sp. nov., an anaerobic bacterium isolated from the pit mud of strong aromatic Chinese liquor, and emended description of the genus <i>Aminipila</i>.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Wei Z, Ma S, Chen R, Wu W, Fan H, Dai L, Deng Y<br><font color=gray><i>International journal of systematic and evolutionary microbiology, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br><br><br><table cellspacing=0 cellpadding=0 align=center><tr valign=bottom><td align=center><img src=p.png border=0></td><td align=center><img src=o_red.png border=0></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=2><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=3><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=4><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=5><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=6><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=7><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=8><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=9><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=10><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=2><img src=rtal.png border=0></a></td></tr><td align=center></td><td align=center>1</td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=2>2</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=3>3</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=4>4</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=5>5</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=6>6</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=7>7</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=8>8</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=9>9</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=10>10</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes+str&category=l&client=pubmed&startPage=2>»</a></td></tr></table></table></tr></table></td><script src="http://www.google-analytics.com/urchin.js" type="text/javascript"> </script> 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