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   Firmicutes 

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Common Names: low GC Gram+, low G+C Gram-positive bacteria, Gram-positive bacteria



111.  Efficacy of olanexidine gluconate in canine superficial pyoderma: a randomised, single-blinded controlled trial.LinkIT
Hsiao YH, Imanishi I, Iyori K
Veterinary dermatologyVet DermatolEfficacy of olanexidine gluconate in canine superficial pyoderma: a randomised, single-blinded controlled trial.664-e17410.1111/vde.13038Topical treatments can be beneficial for managing canine superficial pyoderma. A novel antiseptic agent, olanexidine gluconate, has become available recently for use in humans, and its efficacy for canine pyoderma as topical therapy is unknown.The antimicrobial effect of olanexidine was evaluated using minimal inhibitory concentration (MIC) towards Staphylococcus pseudintermedius. Furthermore, its clinical efficacy in canine superficial pyoderma was assessed in a randomized, single-blinded study.Twenty-eight client-owned dogs with atopic dermatitis and superficial pyoderma.The MIC of olanexidine was determined for S. pseudintermedius isolates (n=73) by serial dilution of 96-well broth microdilution method. Regarding the clinical trial, all recruited dogs were randomized into two groups; one treated with 1.5% olanexidine spray once daily and the other with a 3% chlorhexidine shampoo once a week for 2 times, respectively. Clinical assessment was performed at days 0 and 14 according to the guidelines of the Japanese Society of Antimicrobials for Animals.The MIC values for methicillin-resistant S. pseudintermedius?(MRSP) and methicillin-sensitive?S. pseudintermedius?(MSSP) were 0.23 ?g/ml and 0.24 ?g/ml (P =0.9), respectively. In clinical trial, olanexidine and chlorhexidine showed substantial improvement in clinical presentation compared to the baseline.Olanexidine showed comparable efficacy to chlorhexidine (P=0.73). Moreover, the MIC against?S. pseudintermedius?indicated high bactericidal activity, which was supported by the topical effectiveness of olanexidine.© 2021 ESVD and ACVD.HsiaoYun-HsiaYHhttps://orcid.org/0000-0002-9867-7268Dermatological and Laboratory Service for Animals, Vet Derm Tokyo, 910 Shobusawa, Fujisawa, Kanagawa, 252-0823, Japan.ImanishiIchiroIDepartment of Microbiology, Kitasato University School of Medicine, 1-15-1 Kitasato, Minami-ku, Sagamihara, Kanagawa, 252-0374, Japan.IyoriKeitaKhttps://orcid.org/0000-0003-1977-4201Dermatological and Laboratory Service for Animals, Vet Derm Tokyo, 910 Shobusawa, Fujisawa, Kanagawa, 252-0823, Japan.engJournal ArticleRandomized Controlled Trial, VeterinaryEnglandVet Dermatol94261870959-44930Anti-Bacterial Agents0Biguanides0GlucuronatesI69T4JE922olanexidine gluconateStaphylococcus pseudintermediusIMAnimalsAnti-Bacterial Agentstherapeutic useBiguanidesDog Diseasesdrug therapyDogsGlucuronatesMicrobial Sensitivity TestsveterinaryPyodermadrug therapyveterinaryStaphylococcusLes traitements topiques peuvent être bénéfiques pour la gestion de la pyodermite superficielle canine. Un nouvel agent antiseptique, le gluconate d'olanexidine, est devenu disponible récemment pour une utilisation chez l'homme, et son efficacité pour la pyodermite canine en tant que thérapie topique est inconnue.L'effet antimicrobien de l'olanexidine a été évalué en utilisant la concentration minimale inhibitrice (CMI) contre Staphylococcus pseudintermedius. De plus, son efficacité clinique dans la pyodermite superficielle canine a été évaluée dans une étude randomisée en simple aveugle.Vingt-huit chiens appartenant à des clients atteints de dermatite atopique et de pyodermite superficielle. MATÉRIELS ET METHODS: La CMI de l'olanexidine a été déterminée pour les isolats de S. pseudintermedius (n = 73) par dilution en série de la méthode de microdilution en bouillon à 96 puits. Concernant l'essai clinique, tous les chiens recrutés ont été randomisés en deux groupes ; respectivement, l'un était traité avec un spray d'olanexidine à 1,5% une fois par jour et l'autre avec un shampoing à la chlorhexidine à 3% une fois par semaine à deux reprises. L'évaluation clinique a été réalisée aux jours 0 et 14 selon les directives de la Société japonaise des antimicrobiens pour les animaux. RÉSULTATS: Les valeurs de CMI pour S. pseudintermedius résistant à la méticilline (MRSP) et S. pseudintermedius sensible à la méticilline (MSSP) étaient respectivement de 0,23 g/ml et 0,24 ?g/ml (P = 0,9). Dans les essais cliniques, l'olanexidine et la chlorhexidine ont montré une amélioration substantielle de la présentation clinique par rapport aux données de base.L'olanexidine a montré une efficacité comparable à la chlorhexidine (P=0,73). De plus, la CMI contre S. pseudintermedius indiquait une activité bactéricide élevée, qui était soutenue par l'efficacité topique de l'olanexidine.INTRODUCCIÓN: los tratamientos tópicos pueden ser beneficiosos para controlar la pioderma superficial canina. Un nuevo agente antiséptico, el gluconato de olanexidina, se ha aprobado recientemente para su uso en humanos, y se desconoce su eficacia para la pioderma canina como terapia tópica. OBJETIVO: se evaluó el efecto antimicrobiano de olanexidina utilizando la concentración inhibitoria mínima (MIC) frente Staphylococcus pseudintermedius. Además, su eficacia clínica en la pioderma superficial canina se evaluó en un estudio al azar, simple ciego. ANIMALES: veintiocho perros propietarios particulares con dermatitis atópica y pioderma superficial. MÉTODOS Y MATERIALES: la MIC de olanexidina se determinó para aislados de S. pseudintermedius (n = 73) mediante dilución en serie con el método de microdilución en caldo de 96 pocillos. Con respecto al ensayo clínico, todos los perros seleccionados fueron asignados al azar en dos grupos; uno tratado con un aerosol de olanexidina al 1,5% una vez al día y el otro con un champú de clorhexidina al 3% una vez a la semana 2 veces, respectivamente. La evaluación clínica se realizó los días 0 y 14 de acuerdo con las directrices de la Sociedad Japonesa de Antimicrobianos para Animales. RESULTADOS: los valores de MIC para S. pseudintermedius resistente a meticilina (MRSP) y S. pseudintermedius sensible a meticilina (MSSP) fueron de 0,23 ?g / ml y 0,24 ?g / ml (P = 0,9), respectivamente. En un ensayo clínico, la olanexidina y la clorhexidina mostraron una mejora sustancial en la presentación clínica en comparación con la línea de base. CONCLUSIONES E IMPORTANCIA CLÍNICA: la olanexidina mostró una eficacia comparable a la clorhexidina (p = 0,73). Además, la MIC frente a S. pseudintermedius indicó una alta actividad bactericida, que fue apoyada por la eficacia tópica de olanexidina.Topische Behandlungen können sich beim Management der superfiziellen Pyodermie des Hundes günstig auswirken. Ein neuer antiseptischer Wirkstoff, Olanexidin Gukonat, steht in der letzten Zeit für die Verwendung beim Menschen zur Verfügung. Seine Wirksamkeit bei caniner Pyodermie als topische Therapie ist unbekannt. ZIEL: Die antimikrobielle Wirkung von Olanexidin wurde mittels minimaler Hemmstoffkonzentration (MIC) gegenüber Staphylococcus pseudintermedius evaluiert. Weiters wurde seine klinische Wirksamkeit bei caniner superfizieller Pyodermie in einer randomisierten Einfachblindstudie untersucht.Achtundzwanzig Hunde in Privatbesitz mit atopischer Dermatitis und superfizieller Pyodermie.Die MIC Werte für Methicillin-resistenten S. pseudintermedius (MRSP) und Methicillin-sensiblen S. pseudintermedius (MSSP) betrugen 0,23 µg/ml bzw 0,24 µg/ml (P =0,9). Im klinischen Versuch zeigten Olanexidin und Chlorhexidin im Vergleich zur Ausgangsbasis eine deutliche Verbesserung bei der klinischen Präsentation.Olanexidin zeigte eine mit Chlorhexidin vergleichbare Wirksamkeit (P=0,73). Darüber hinaus wies die MIC gegenüber S. pseudintermedius auf eine hohe bakterizide Aktivität hin, was durch die oberflächliche Wirksamkeit von Olanexidin unterstützt wird.??: ?????????????????????????????????Olanexidine gluconate????????????????????????????????????????????????????????????? ??: ?????????????Staphylococcus pseudintermedius?????????????MIC????????????????????????????????????????????????? ????: ?????????????????????28???????????????? ?????: S. pseudintermedius????n=73?????????????MIC??96?????????????????????????????????????????????2?????????1.5?????????????1?1?????????3????????????????1??2??????????????????????????????????0???14??????? ??: ??????S. pseudintermedius?MRSP????????????S. pseudintermedius?MSSP??MIC???????0.23 ?g/ml???0.24 ?g/ml?P = 0.9??????????????????????????????????????????????????????????? ????????????: ????????????????????????????P?0.73??????S. pseudintermedius????MIC???????????????????????????????????.??: ???????????????????????????????????????????????????????? ??: ??????????????????(MIC)?????????????????????????????????????????????? ??: 28??????????????????? ?????: ??96???????????????????????????(n = 73)????? MIC?????????????????????????1.5%????????????????????3%??????????????2?????????????????????0???14???????? ??: ??????????????(MRSP)???????????????(MSSP)?MIC????0.23 ?g/mL?0.24 ?g/mL(P = 0.9)?????????????????????????????????? ????????: ?????????????(P = 0.73)??????????????MIC????????????????????????????.INTRODUÇÃO: Os tratamentos tópicos podem ser benéficos para o manejo da piodermite superficial canina. Um novo agente anti-séptico, gluconato de olanexidina, tornou-se recentemente disponível para uso em humanos, e sua eficácia para piodermite canina como terapia tópica é desconhecida.O efeito antimicrobiano da olanexidina foi avaliado através da concentração inibitória mínima (MIC) para Staphylococcus pseudintermedius. Além disso, sua eficácia clínica na piodermite superficial canina foi avaliada em um estudo randomizado simples-cego.Vinte e oito cães de clientes com dermatite atópica e piodermite superficial. MÉTODOS E MATERIAIS: A MIC de olanexidina foi determinada para isolados de S. pseudintermedius (n=73) por diluição em série utilizando o método de microdiluição em caldo com 96 poços. Em relação ao ensaio clínico, todos os cães recrutados foram divididos aleatoriamente em dois grupos; um grupo foi tratado com spray de olanexidina 1,5% uma vez ao dia e o outro com xampu de clorexidina 3% uma vez por semana por 2 vezes, respectivamente. A avaliação clínica foi realizada nos dias 0 e 14 de acordo com as diretrizes da Sociedade Japonesa de Antimicrobianos para Animais.Os valores de MIC para S. pseudintermedius resistente à meticilina (MRSP) e S. pseudintermedius sensível à meticilina (MSSP) foram 0,23 ?g/ml e 0,24 ?g/ml (P=0,9), respectivamente. No ensaio clínico, a olanexidina e a clorexidina demonstraram melhora significativa na apresentação clínica em comparação ao tempo zero. CONCLUSÕES E IMPORTÂNCIA CLÍNICA: Olanexidina demonstrou eficácia comparável à clorexidina (P=0,73). Além disso, a MIC contra S. pseudintermedius indicou alta atividade bactericida, concordando com a eficácia tópica da olanexidina.2021061020200914202108152021111971320211120602021112360ppublish3479656310.1111/vde.13038References, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>112.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>Whole genome sequencing and de novo assembly of Staphylococcus pseudintermedius: a pangenome approach to unravelling pathogenesis of canine pyoderma.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Ferrer L, García-Fonticoba R, Pérez D, Viñes J, Fàbregas N, Madroñero S, Meroni G, Martino PA, Martínez S, Maté ML, Sánchez-Bruni S, Cuscó A, Migura-García L, Francino O<br><font color=gray><i>Veterinary dermatologyVet DermatolWhole genome sequencing and de novo assembly of Staphylococcus pseudintermedius: a pangenome approach to unravelling pathogenesis of canine pyoderma.654-66310.1111/vde.13040Staphylococcus pseudintermedius is the main aetiological agent of canine pyoderma. Whole genome sequencing is the most comprehensive way of obtaining relevant genomic information about micro-organisms.Oxford Nanopore technology enables quality sequencing and de novo assembly of the whole genome of S.?pseudintermedius. Whole genome analysis of S.?pseudintermedius may help to better understand the pathogenesis of canine pyodermas.Twenty-two strains of S.?pseudintermedius isolated from the skin of five healthy dogs and 33 strains isolated from skin of 33 dogs with pyoderma were analysed. DNA was extracted and sequenced using Oxford Nanopore MinION, a new technology that delivers longer reads in a hand-held device. The pangenome was analysed and visualised with Anvi'o 6.1.Nanopore technology allowed the sequencing and de novo assembly of the genomes of 55 S.?pseudintermedius strains isolated from healthy dogs and from dogs with pyoderma. The average genome size of S.?pseudintermedius was 2.62?Mbp, with 48% being core genome. Pyoderma isolates contained a higher number of antimicrobial resistance genes, yet the total number of virulence factors genes did not change between isolates from healthy dogs and from dogs with pyoderma. Genomes of meticillin-resistant S.?pseudintermedius (MRSP) strains were larger than those of meticillin-susceptible (MSSP) strains (2.80?Mbp versus 2.59?Mbp), as a consequence of a greater presence of antimicrobial resistance genes, phages and prophages.This technique allows much more precise and easier characterisation of canine S.?pseudintermedius populations and may lead to a better understanding of the pathogenesis of canine pyodermas.© 2021 The Authors. Veterinary Dermatology published by John Wiley & Sons Ltd on behalf of ESVD and ACVD.FerrerLluísLhttps://orcid.org/0000-0003-1537-0074Departament de Medicina i Cirurgia Animals, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain.García-FonticobaRocíoRhttps://orcid.org/0000-0003-4176-3402Departament de Medicina i Cirurgia Animals, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain.PérezDanielDhttps://orcid.org/0000-0002-7301-4791Servei Veterinari de Genètica Molecular, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain.ViñesJoaquimJhttps://orcid.org/0000-0003-0709-5236Servei Veterinari de Genètica Molecular, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain.Vetgenomics, PRUAB, Bellaterra, Barcelona, Spain.FàbregasNormaNhttps://orcid.org/0000-0002-6232-6992Vetgenomics, PRUAB, Bellaterra, Barcelona, Spain.MadroñeroSergiShttps://orcid.org/0000-0001-8852-2062Servei Veterinari de Genètica Molecular, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain.MeroniGabrieleGhttps://orcid.org/0000-0003-2772-6410Department of Biomedical, Surgical and Dental Sciences - One Health Unit, Via Pascal 36, Milano, 20133, Italy.MartinoPiera APAhttps://orcid.org/0000-0003-0108-638XDepartment of Biomedical, Surgical and Dental Sciences - One Health Unit, Via Pascal 36, Milano, 20133, Italy.MartínezSofíaShttps://orcid.org/0000-0002-0204-9639Hospital Escuela de Pequeños Animales (HEPA), Centro de Investigación Veterinaria de Tandil (CIVETAN), UNCPBA-CONICET-CICPBA, Grupo de Medicina Veterinaria Traslacional (MEVET), Facultad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires (FCV-UNCPBA), Tandil, Argentina.MatéM LauraMLLaboratorio de Farmacología, Centro de Investigación Veterinaria de Tandil (CIVETAN), UNCPBA-CONICET-CICPBA, Facultad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional del Centro (FCV-UNCPBA), Tandil, Argentina.Sánchez-BruniSergioShttps://orcid.org/0000-0002-9598-6786Laboratorio de Farmacología, Centro de Investigación Veterinaria de Tandil (CIVETAN), UNCPBA-CONICET-CICPBA, Facultad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional del Centro (FCV-UNCPBA), Tandil, Argentina.CuscóAnnaAhttps://orcid.org/0000-0002-9574-5755Vetgenomics, PRUAB, Bellaterra, Barcelona, Spain.Migura-GarcíaLourdesLhttps://orcid.org/0000-0003-2935-928XCentre de Recerca en Sanitat Animal, IRTA, Bellaterra, Barcelona, Spain.FrancinoOlgaOhttps://orcid.org/0000-0002-9022-3835Servei Veterinari de Genètica Molecular, Universitat Autònoma de Barcelona, Barcelona, Spain.engRTI2018-101991-B-100Ministerio de Ciencia e Innovación, Spain2017DI037Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaTorres Quevedo Project PTQ2018-009961Ministerio de Ciencia e Innovación, SpainJournal ArticleEnglandVet Dermatol94261870959-4493Staphylococcus pseudintermediusIMAnimalsDog DiseasesDogsPyodermaveterinaryStaphylococcusgeneticsWhole Genome SequencingveterinaryStaphylococcus pseudintermedius est le principal agent étiologique de la pyodermite canine. Le séquençage du génome entier est le moyen le plus complet d'obtenir des informations génomiques pertinentes sur les micro-organismes. HYPOTHÈSE/OBJECTIFS: La technologie Oxford Nanopore permet un séquençage de qualité et un assemblage de novo de l'ensemble du génome de S. pseudintermedius. L'analyse du génome entier de S. pseudintermedius peut aider à mieux comprendre la pathogénie des pyodermites canines. MÉTHODES ET MATERIEL: Vingt-deux souches de S. pseudintermedius isolées de la peau de cinq chiens sains et 33 souches isolées de la peau de 33 chiens atteints de pyodermite ont été analysées. L'ADN a été extrait et séquencé à l'aide d'Oxford Nanopore MinION, une nouvelle technologie qui offre des lectures plus longues dans un appareil portatif. Le pangénome a été analysé et visualisé avec ANVI'O 6.1. RÉSULTATS: La technologie Nanopore a permis le séquençage et l'assemblage de novo des génomes de 55 souches de S. pseudintermedius isolées de chiens sains et de chiens atteints de pyodermite. La taille moyenne du génome de S. pseudintermedius était de 2,62 Mpb, dont 48 % étaient le génome central. Les isolats de pyodermite contenaient un nombre plus élevé de gènes de résistance aux antimicrobiens, mais le nombre total de gènes de facteurs de virulence n'a pas changé entre les isolats de chiens sains et de chiens atteints de pyodermite. Les génomes des souches de S. pseudintermedius résistantes à la méticilline (MRSP) étaient plus grands que ceux des souches sensibles à la méticilline (MSSP) (2,80 Mbp contre 2,59 Mbp), en raison d'une plus grande présence de gènes de résistance aux antimicrobiens, de phages et de prophages.Cette technique permet une caractérisation beaucoup plus précise et plus facile des populations canines de S. pseudintermedius et peut conduire à une meilleure compréhension de la pathogénie des pyodermites canines.INTRODUCCIÓN: Staphylococcus pseudintermedius es el principal agente etiológico de la pioderma canina. La secuenciación del genoma completo es la forma más completa de obtener información genómica relevante sobre microorganismos. HIPÓTESIS/OBJETIVOS: la tecnología Oxford Nanopore permite la secuenciación de calidad y el ensamblaje de novo de todo el genoma de S. pseudintermedius. El análisis del genoma completo de S. pseudintermedius puede ayudar a comprender mejor la patogenia de las piodermas caninas. MÉTODOS Y MATERIALES: Se analizaron veintidós cepas de S. pseudintermedius aisladas de la piel de cinco perros sanos y 33 cepas aisladas de la piel de 33 perros con pioderma. El DNA se extrajo y secuenció utilizando Oxford Nanopore MinION, una nueva tecnología que ofrece lecturas más largas en un dispositivo de mano. El pangenoma se analizó y visualizó con ANVI?O 6.1. RESULTADOS: la tecnología Nanopore permitió la secuenciación y el ensamblaje de novo de los genomas de 55 cepas de S. pseudintermedius aisladas de perros sanos y de perros con pioderma. El tamaño medio del genoma de S. pseudintermedius fue de 2,62 Mbp, con un 48% de genoma central. Los aislados de pioderma contenían un mayor número de genes de resistencia a los antimicrobianos, sin embargo, el número total de genes de factores de virulencia no cambió entre los aislados de perros sanos y los de perros con pioderma. Los genomas de las cepas de S. pseudintermedius resistentes a la meticilina (MRSP) fueron más grandes que los de las cepas sensibles a la meticilina (MSSP) (2,80 Mbp versus 2,59 Mbp), como consecuencia de una mayor presencia de genes de resistencia a los antimicrobianos, fagos y profagos. CONCLUSIONES E IMPORTANCIA CLÍNICA: esta técnica permite una caracterización mucho más precisa y sencilla de las poblaciones caninas de S. pseudintermedius y puede conducir a una mejor comprensión de la patogenia de las piodermas caninas.Staphylococcus pseudintermedius stellt die hauptsächliche ätiologische Ursache für die canine Pyodermie dar. Eine Gesamtgenomsequenzierung ist der umfassendste Weg, um relevante Genominformation über Mikroorganismen zu erhalten.Die Oxford Nanopore Technologie ermöglicht eine qualitative Sequenzierung und eine de novo Anordnung des Gesamtgenoms von S. pseudintermedius. Die Gesamtgenomsequenzierung von S. pseudintermedius könnte dabei helfen, die Pathogenese der caninen Pyodermie besser zu verstehen.Zweiundzwanzig Stämme von S. pseudintermedius, die von der Haut von fünf gesunden Hunden und 33 Stämme, die von 33 Hunden mit Pyodermie isoliert worden waren, wurden analysiert. DNA wurde extrahiert und mittels Oxford Nanopore MinION, einer neuen Technologie, die längere Sequenzen in einem Handgerät liefert, sequenziert. Das Pangenom wurde analysiert und mittels ANVI´O 6.1. analysiert.Die Nanopore Technologie ermöglichte eine Sequenzierung und de novo Anordnung der Genome von 55 S. pseudintermedius Stämmen, die von gesunden Hunden und von Hunden mit Pyodermie isoliert worden waren. Die durchschnittliche Genom Länge von S. pseudintermedius betrug 2,62 Mbp, wobei 48% davon das Hauptgenom ausmachte. Pyodermie Isolate beinhalteten eine größere Anzahl an antimikrobiellen Resistenzgenen; die Gesamtzahl der Virulenzfaktorgene unterschied sich allerdings nicht zwischen den Isolaten von gesunden Hunden und von Hunden mit Pyodermie. Genome von Methicillin-resistenten S. pseudintermedius (MRSP) Stämmen waren größer als jene der Methicillin-sensiblen (MSSP) Stämme (2,8 Mbp versus 2,59 Mbp), was eine Folge der vermehrten Präsenz von antimikrobiellen Resistenzgenen, Phagen und Prophagen war.Diese Technik erlaubt eine wesentlich präzisere und einfachere Charakterisierung der caninen S. pseudintermedius Populationen und könnte zu einem besseren Verstehen der Pathogenese der caninen Pyodermien führen.??: Staphylococcus pseudintermedius????????????????????????????????????????????????????????????? ??/??: Oxford Nanopore??????????S?pseudintermedius????????????????denovo?????????????? S. pseudintermedius???????????????????????????????????????? ?????: 5????????????????S.pseudintermedius?22???????33?????????????33?????????? DNA??????????????????????????????????????Oxford Nanopore MinION???????????????????????????ANVI?O6.1??????????????? ??: Nanopore???????????????????????????55?S.pseudintermedius???????????denovo??????????????? S.pseudintermedius??????????2.62Mbp??48??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????S.pseudintermedius?MRSP?????????????????????????????????????????????????????MSSP???????????????2.80Mbp?2.59Mbp?? ?????????: ??????????S. pseudintermedius???????????????????????????????????????????????????.??: ????????????????????????????????????????????? ??/??: ?????????????????????????????????????????????????????????????????????? ?????: ?5??????????22?????33???????????33?????????????????????? MinION??DNA??????????????????????????????ANVI'O 6.1????????????? ??: ?????????????55????????????????????????????????????????????????2.62 Mbp???48%?????????????????????????????????????????????????????????????????????????(MRSP)?????????????(MSSP)????????2.80 Mbp?2.59 Mbp???????????????????????????? ????????: ???????????????????????????????????????????????.Staphylococcus pseudintermedius é o principal agente etiológico da piodermite canina. O sequenciamento completo do genoma é a forma mais aprofundada de se obter informações genômicas relevantes sobre microrganismos. HIPÓTESE/OBJETIVOS: A tecnologia de Oxford Nanopore permite o sequenciamento de boa qualidade e montagem ?de novo? do genoma completo de S. pseudintermedius. A análise do genoma completo de S. pseudintermedius pode auxiliar na melhor compreensão da patogênese da piodermite canina. MÉTODOS E MATERIAIS: Vinte e duas cepas de S. pseudintermedius isoladas da pele de cinco cães saudáveis e 33 cepas isoladas da pele de 33 cães com piodermite foram analisadas. O DNA foi extraído e sequenciado utilizando Oxford Nanopore MinION, uma tecnologia nova que fornece leituras mais longas em um aparelho portátil. O pangenoma foi analisado e visualizado com ANVI?O 6.1.A tecnologia Nanopore permitiu o sequenciamento e a montagem ?de novo? dos genomas de 55 cepas de S. pseudintermedius isoladas de cães saudáveis de cães com piodermite. A média do tamanho do genoma de S. pseudintermedius foi de 2,62 Mbp, sendo 48% de genoma base. Os isolados de piodermite continham um maior número de genes de resistência antimicrobiana, apesar de o número total de fatores de virulência não sofreu alteração entre os isolados de cães saudáveis e de cães com piodermite. Os genomas das cepas S. pseudintermedius resistentes à meticilina (MRSP) foram maiores que aqueles das cepas suscetíveis à meticilina (MSSP) (2,80 Mbp versus 2,59 Mbp), como consequência da maior presença de genes de resistência antimicrobiana, fagos e profagos. CONCLUSÕES E IMPORTÂNCIA CLÍNICA: A técnica testada permite uma caracterização muito mais simples e precisa das populações de S. pseudintermedius canino e pode levar ao melhor entendimento da patogênese da piodermite canina.2021091520210123202109232021111971320211120602021112360ppublish3479656110.1111/vde.13040References, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>113.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>[Effects of reactive oxygen species-responsive antibacterial microneedles on the full-thickness skin defect wounds with bacterial colonization in diabetic mice].</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Zhang QR, Yang X, Li Z, Jia JZ, Luo GX, Yu YL, Zhang Y<br><font color=gray><i>Zhonghua shao shang za zhi = Zhonghua shaoshang zazhi = Chinese journal of burns, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>114.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>Multi-faceted influences of biochar addition on swine manure digestion under tetracycline antibiotic pressure.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Wang G, Chu Y, Zhu J, Sheng L, Liu G, Xing Y, Fu P, Li Q, Chen R<br><font color=gray><i>Bioresource technology, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>115.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>Molecular Characterization Based on Whole-Genome Sequencing of <i>Streptococcus pneumoniae</i> in Children Living in Southwest China During 2017-2019.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Yan Z, Cui Y, Huang X, Lei S, Zhou W, Tong W, Chen W, Shen M, Wu K, Jiang Y<br><font color=gray><i>Frontiers in cellular and infection microbiology, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>116.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title><i>Lactobacillus rhamnosus</i> LB1 Alleviates Enterotoxigenic <i>Escherichia coli</i>-Induced Adverse Effects in Piglets by Improving Host Immune Response and Anti-Oxidation Stress and Restoring Intestinal Integrity.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Wu T, Shi Y, Zhang Y, Zhang M, Zhang L, Ma Z, Zhao D, Wang L, Yu H, Hou Y, Gong J<br><font color=gray><i>Frontiers in cellular and infection microbiology, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>117.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>[Valve Replacement for Isolated Pulmonary Valve Infective Endocarditis without Congenital Heart Defects:Report of a Case].</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Kobayashi M, Higashiue S, Kuroyanagi S, Furuya O, Hiramatsu N, Matsuura M, Kasuga K, Takemoto T, Ishidou K<br><font color=gray><i>Kyobu geka. The Japanese journal of thoracic surgery, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>118.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>The spread and antimicrobial resistance of Staphylococcus aureus in South African dairy herds - A review.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Karzis J, Petzer IM, Naidoo V, Donkin EF<br><font color=gray><i>The Onderstepoort journal of veterinary research, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>119.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>Dietary grape pomace - effects on growth performance, intestinal health, blood parameters, and breast muscle myopathies of broiler chickens.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Erinle TJ, Oladokun S, MacIsaac J, Rathgeber B, Adewole D<br><font color=gray><i>Poultry science, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br>120.  <a href=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0 class=title>An <i>in vitro</i> investigation of the phytochemical contents of <i>Marsdenia macrantha</i> root and its antibacterial activity against selected foodborne pathogens.</a><a href=http://ubio.org/tools/linkit.php?map%5B%5D=all&link_type=2&url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0><img src=linkit.png border=0 title='LinkIT' alt='LinkIT'></a> <br><span class=j>Shikwambi NC, Onywera H, Mwapagha LM<br><font color=gray><i>The Pan African medical journal, 2021</i></font><br><font color=#008000>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=pubmed&dopt=Abstract&list_uids=0<br></font></span><br><br><br><table cellspacing=0 cellpadding=0 align=center><tr valign=bottom><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=11><img src=p.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=2><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=3><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=4><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=5><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=6><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=7><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=8><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=9><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=10><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=11><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><img src=o_red.png border=0></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=13><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=14><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=15><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=16><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=17><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=18><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=19><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=20><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=21><img src=o_yellow.png border=0></a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=13><img src=rtal.png border=0></a></td></tr><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=11>«</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=2>2</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=3>3</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=4>4</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=5>5</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=6>6</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=7>7</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=8>8</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=9>9</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=10>10</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=11>11</a></td><td align=center>12</td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=13>13</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=14>14</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=15>15</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=16>16</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=17>17</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=18>18</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=19>19</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=20>20</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=21>21</a></td><td align=center><a href=http://ubio.org/portal/index.php?search=Firmicutes&category=l&client=pubmed&startPage=13>»</a></td></tr></table></table></tr></table></td><script src="http://www.google-analytics.com/urchin.js" type="text/javascript"> </script> <script 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